Työterveyshuollon kustannukset muodostuvat perusmaksusta ja työterveyshenkilöstön sekä heidän tarvitsemiensa asiantuntijoiden palveluiden käytöstä. Palvelut kohdistuvat työolosuhteisiin, työyhteisöön tai yksittäiseen työntekijään. Työterveyshuoltopalvelujen laajuus määritellään yhdessä työnantajan kanssa tehtävässä sopimuksessa.

Kustannukset jaetaan kahteen korvausluokkaan. Korvausluokkaan I kuuluvat lakisääteiset palvelut ja korvausluokkaan II kuuluvat yleislääkäritasoiset sairaanhoitopalvelut.

Työtapaturmista aiheutuneet sairaanhoidon kustannukset laskutamme suoraan vakuutusyhtiöltä. Kansaneläkelaitos korvaa kustannuksista työnantajalle harkintansa mukaan 50 % tilikauden jälkeen tehdyn korvaushakemuksen perusteella. Työnantajalle korvataan 60 % ennaltaehkäisevän työterveyshuollon kustannuksista, jotka ovat aiheutuneet esim. työpaikkakäynneistä, terveystarkastuksista sekä työsuojelutoimikunnan kokouksiin osallistumisesta. Korvauksen hakuaika on 6 kk tilikauden päättymisen jälkeen. Kelan korvaus koskee myös sairaanhoitoa, hankittuja ensiapuvälineitä ja ensiapukurssista aiheutuneita kuluja. Työterveyshuolto toimittaa korvaushakemuksen työnantajalle.

Yrittäjä ja muu omaa työtään tekevä esim. maatalousyrittäjä voi järjestää itselleen työterveyshuoltopalvelut. Työplus hakee Kelan korvausosuuden tilitysmenettelyn kautta ja perii yrittäjältä vain omavastuuosuuden työterveyshuollon palveluista. Maatalousyrittäjien työterveyshuoltoon kuuluvat tilakäynnit, työolosuhdehaastattelut ja tarvittavien erityisasiantuntijoiden käyttö.